Cancer : la carte des protéines dans les cellules tumorales indique une thérapie

Par Jason Arunn Murugesu

La toute première carte de la façon dont les protéines interagissent dans le cancer met en évidence des mutations auparavant négligées qui pourraient être ciblées pour la thérapie.

Trey Ideker de l’Université de Californie, San Diego, et ses collègues ont conçu une carte qui a examiné comment plusieurs dizaines de protéines cancéreuses communes interagissent dans le cancer du sein et dans cancer de la tête et du cou.

« Les gènes du cancer n’agissent pas seuls », explique Ideker. « C’est comme les pièces de n’importe quelle machine – elles s’influencent mutuellement. »

Les cartes d’interaction protéique impliquent de cataloguer toutes les différentes manières dont les protéines interagissent les unes avec les autres dans un système biologique. Dans ce cas, l’équipe a sélectionné 61 protéines couramment mutées dans les deux cancers et a déterminé comment elles interagissaient chacune les unes avec les autres et avec les centaines d’autres protéines présentes dans les tumeurs cancéreuses.

« Nous recherchons des communautés de protéines qui sont sous pression pour muter pendant le cancer », explique Ideker.

Pour le cancer de la tête et du cou, l’équipe a trouvé 771 interactions protéiques impliquant environ 650 protéines – et 84 pour cent des interactions n’avaient jamais été signalées auparavant. Si ces interactions sont critiques pour la croissance tumorale, les futurs médicaments oncologiques qui les ciblent et les perturbent pourraient ralentir la croissance des cancers.

Pendant ce temps, en examinant les données dans leur ensemble, l’équipe a découvert une mutation de la protéine collagène qui avait été négligée par des recherches antérieures.

« C’est la grande avancée de l’étude », dit Ideker. « Il y a eu des anecdotes sur la découverte de mutations cancéreuses de cette façon auparavant, mais personne n’a systématiquement montré cela. »

Ideker espère que la méthode sera utilisée dans d’autres cancers et que d’autres se joindront à la quête pour cartographier encore plus d’interactions protéiques dans le cancer. Non seulement cela aidera-t-il à trouver de nouveaux médicaments, dit-il, mais cela aidera également les scientifiques à trouver de nouveaux biomarqueurs du cancer – ce qui aidera les médecins à concevoir des traitements plus personnalisés.

«En identifiant quelles protéines travaillent souvent ensemble dans des cancers spécifiques et en nous aidant à comprendre comment les mutations affectent ces interactions protéiques, cette recherche nous aide à mieux comprendre le développement et la progression du cancer», explique Chris Will à l’Institute of Cancer Research au Royaume-Uni.

Mais il note que les chercheurs n’ont examiné qu’un petit nombre de protéines et que l’intérêt principal de l’étude est donc de souligner comment les interactions protéiques peuvent être mieux cartographiées dans le cancer en premier lieu.

« Il faudra encore beaucoup de travail, dit-il.

Référence de la revue : Science, DOI : 10.1126/science.abf2911

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